Если ИП на патенте ведет деятельность со ставкой 0% и с другой ставкой - все равно нужно вести раздельный учет.
Налогоплательщик, использующий ПСН и применяющий налоговую ставку в размере 0%, должен вести раздельный учет своих доходов, пояснили налоговики в рубрике вопросов и ответов.
Если налогоплательщик занимается деятельностью, в отношении которой применяется ПСН с нулевой ставкой, и деятельностью на патенте со ставкой 6%, или совмещает с другими режимами налогообложения - то этот налогоплательщик обязан вести раздельный учет доходов.
Источник :Клерк.Ру